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REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒操作指南

更新時間:2017-11-07瀏覽:5035次

 

試劑盒組份

 

組份

規(guī)格

REPLI-g sc DNA Polymerase (blue lid)

DNA聚合酶(藍蓋)

48 µl

REPLI-g sc Reaction Buffer (yellow lid)

反應緩沖液(黃蓋)

700 µl

Buffer DLB (clear lid)

DLB緩沖液(透明蓋)

1 tube

Stop Solution (red lid)

終止液(紅蓋)

1.8 ml

PBS sc 1x (clear lid)

PBS 1x透明蓋

1.5 ml

DTT, 1 M (lilac lid)

DTT,1M(紫蓋)

1 ml

H2O sc

1.5 ml

Quick Start Protocol

1

 

 

操作方法選擇

根據(jù)起始樣本選擇操作方法

起始樣本

方法

單細胞,2-1000個細胞

方法一:從單細胞擴增基因組DNA

純化基因組DNA(1-10ng)

方法二:純化基因組DNA擴增

其他起始樣本:血漿血清、活檢、需要高通量擴增的樣本等參見其他對應說明書。

 

操作流程

 

 

 

方法*程

細胞樣本——加入變性混合液——65°C孵育10min——加入終止液——加入Master混合液——30°C孵育8h,65°C 終止3min——獲得擴增DNA

 

方法二流程

純化基因組DNA——加入變性混合液——15-25°C孵育3min——加入neutralization混合液——加入Master混合液——30°C孵育8h,65°C 終止3min——獲得擴增DNA

 

 

 

 

需要自備的儀器和試劑

微離心管

水浴或其他加熱儀器

微型離心機

漩渦混合儀(Vortexer)

吸管和吸頭

 

方法一:從單細胞擴增基因組DNA

實驗開始前注意事項

1.適用樣本:1-1000個完整細胞

這個方法適用于所有物種的單細胞樣本,如:脊椎動物,細菌(革蘭氏陽性菌和陰性菌),植物(細胞壁已脫),分選細胞,組織培養(yǎng)細胞和細胞。

不適用樣本:福爾馬林固定樣本或其他使用交聯(lián)劑固定的樣本,如:從福爾馬林固定石蠟包埋組織中激光顯微切割得到的單細胞樣本。

2.小心試劑不要被外源DNA污染。如:使用干凈獨立吸頭吸管,在無DNA地方進行反應操作。

3.純化基因組DNA擴增參見方法二。

4.聚合酶要在冰上解凍(見步驟6)。其他成分可以室溫解凍(15–25°C)。

5.配制的D2緩沖液(變性緩沖液)存放不要超過3個月。

6.陰性對照(無模板)的DNA產(chǎn)量約 40 µg。因為REPLI-g 的單細胞擴增反應中,引物二聚體的隨機擴增得到高分子量的DNA產(chǎn)物。這一DNA不會影響實際樣本質(zhì)量,也不會影響下游分析造成陽性結(jié)果。

 

開始前準備

1.DLB緩沖液加500µl試劑盒的水混勻,稍微離心溶解。

注意:重組的DLB緩沖液–20°C能放6個月。

Buffer DLB is pH-labile.

2.所有緩沖液和試劑使用前都要用漩渦混合器充分混勻。

3.水浴,heating block或熱循環(huán)儀溫度設(shè)為30°C。

如果熱循環(huán)儀帶加熱蓋,蓋子溫度設(shè)為70°C。

 

步驟¢

1.按表1配制足量(整個擴增流程所需)D2緩沖液(變性緩沖液)。

注意:表中提供的D2緩沖液用量足夠進行12次反應。沒用完的D2緩沖液–20°C 存放,但不要存放超過3個月。

 

表1.D2緩沖液配制

成分

體積

DTT, 1 M

3 µl

Buffer DLB (reconstituted)

DLB緩沖液(重組,見“開始前準備”)

33 µl

總體積

36 µl

 

2. 4 µl樣本細胞(含PBS)加入微離心管。如果細胞不夠4 µl,加PBS sc補齊。

注意:REPLI-g單細胞擴增試劑盒提供的PBS sc量不夠用于樣本細胞的連續(xù)稀釋。

可以使用0.5 µl 全血。(Alternatively, 0.5 µl whole blood can be used.

3.加入3 µl 配制的D2緩沖液。小心輕彈試管混勻,稍微離心。

注意:確保樣本細胞沒有貼在緩沖液線上的管壁。

4.65°C孵育10min。

  1. 加入3 µl 終止液。小心輕彈試管混勻,稍微離心。冰上保存。

 

6.冰上解凍REPLI-g sc DNA聚合酶。其他成分室溫解凍,漩渦振蕩后稍微離心。

解凍后REPLI-g sc反應緩沖液可能會形成沉淀,漩渦振蕩10s可以溶解沉淀。

7.按表2配制master混合液?;靹颍晕㈦x心。

要點:嚴格按照表2所列順序配制。加入水和反應緩沖液后,稍微漩渦振蕩和離心后再加入DNA聚合酶。

注意:一次性進行多次反應時,根據(jù)反應數(shù)量等比例增加用量。DNA聚合酶加好后maste混合液要立即投入使用。

 

表2:master混合液配制

成分

體積/反應

H2O sc

9 µl

REPLI-g sc Reaction Buffer

反應緩沖液

29 µl

REPLI-g sc DNA Polymerase

DNA聚合酶

2 µl

總體積

40 µl

多次反應,根據(jù)反應數(shù)量等比例增加劑量并增加10%。

 

8.每次反應,10 µl 變性DNA(步驟5)加入40 µl master 混合液。

9.30°C孵育8h。

30°C孵育后,水浴或其他加熱儀可以改設(shè)為65°C方便步驟10使用。

注意:如果使用帶加熱蓋的熱循環(huán)儀,蓋子溫度設(shè)為70°C。

10.DNA聚合酶65°C滅活3min。

 

11.如果不直接使用,擴增DNA 短期儲存在4°C,長期儲存在–20°C。

使用REPLI-g 單細胞擴增試劑盒擴增的DNA可以當作基因組DNA(zui低凍融循環(huán)),因此推薦zui低核酸儲存密度為100 ng/µl。

12.依照說明書用水或TE適量稀釋擴增DNA。用于PCR分析的擴增DNA按1:100稀釋,每次PCR反應使用2 µl 稀釋后DNA。

13.擴增DNA可用于一系列下游應用,包括:第二代測序,array CGH和定量PCR。

注意:每50 µl典型反應的DNA產(chǎn)量約40 µg,需要正確稀釋。擴增DNA定量見附件A。

 

方法二:純化基因組DNA擴增

略。詳情參見原版說明書。中文版翻譯可咨詢紅榮微再。

 

150343 REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒說明書節(jié)選紅榮微再翻譯整理。

 

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很多研究人員使用二代測序儀器對生物樣本的DNA序列進行分析和基因分型,但經(jīng)常受限于有限的樣本量。150343 REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒可均一的擴增單個細胞(1至1000個細菌或腫瘤細胞)或純化的基因組DNA,能夠覆蓋基因組所有位點。另有于干血或新鮮或冷凍的組織樣本的實驗方案。所有緩沖液和試劑生產(chǎn)都經(jīng)過嚴格控制的流程,避免污染DNA,確保每次實驗獲得可靠的結(jié)果。該產(chǎn)品采用多重置換擴增(MDA)技術(shù),對所有基因組位點進行無偏差的擴增。與基于PCR的全基因組擴增技術(shù)相比,該技術(shù)具有更好的擴增高保真度,避免出現(xiàn)假陽性或假陰性信號。


產(chǎn)品訂購信息

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產(chǎn)品描述

QiaGen

150343

REPLI-g Single Cell Kit單細胞擴增試劑盒

 

 

紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司以“傳遞科學價值,服務(wù)科學研究”為宗旨,主營:干細胞、醫(yī)療、細胞治療、器官再生 四大板塊的產(chǎn)品。

 

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