Streck品牌cfDNA采血管的穩(wěn)定性分享
Streck品牌cfDNA采血管可實(shí)現(xiàn)全血采集樣品中cfDNA規(guī)范化(標(biāo)準(zhǔn)化)??捎糜跓o(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因篩查/無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)(NIPS/NIPT)和液體生物監(jiān)測(cè)(液體活檢,Liquid Biopsy)的規(guī)范化,提高檢驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。
1. 時(shí)間穩(wěn)定性(Time Stability)
CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血,其Cell-free DNA可以在室溫(22?C) 下能穩(wěn)定保存長(zhǎng)達(dá)28天!
結(jié)論來(lái)自如下監(jiān)測(cè):在不同時(shí)間下,對(duì)室溫保存在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中的血液,取血漿使用droplet digital PCR檢測(cè)β-Actin基因片段,用以反映cell-free DNA濃度,發(fā)現(xiàn)與初始采集時(shí)比較,保存長(zhǎng)達(dá)28天后該基因沒(méi)有發(fā)生顯著改變。而K3EDTA采血管無(wú)法實(shí)現(xiàn)在室溫下的長(zhǎng)時(shí)間保存。在第3天,β-Actin已經(jīng)呈現(xiàn)顯著升高,cell-free DNA濃度持續(xù)升高,至28天時(shí),濃度升高上千倍之多。
2. ctDNA穩(wěn)定性
Blood Exo DNA ProTeck® tubes保存血樣,血液中的腫瘤DNA室溫(22?C)穩(wěn)定保存28天。
該結(jié)果來(lái)自于對(duì)野生型KRAS DNA濃度的檢測(cè):Blood Exo DNA ProTeck® tubes能讓血液中的KRAS DNA室溫(22?C)穩(wěn)定保存28天,而K3EDTA保存管無(wú)法實(shí)現(xiàn)。
將來(lái)源于細(xì)胞系的已知量的KRAS外顯子2 G13D突變的腫瘤cell-free DNA作為內(nèi)參照加入到采集的血樣中,使用therasreen KRAS RGQ PCR試劑盒和Rotor Gene real time PCR儀檢此內(nèi)參。在K3EDTA采血管保存的血樣中,發(fā)現(xiàn)僅在采集日可以檢出,而B(niǎo)lood Exo DNA ProTeck® tubes中保存的血樣,22°C下保存28天依舊可以檢出。
3. 溫度穩(wěn)定性(Temperature stability)
使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血在4?C到30?C間都能保持cell-free DNA穩(wěn)定。
無(wú)論使用Qubit® dsDNA HS檢測(cè)法,還是使用droplet digital PCR檢測(cè)RASSF1A,在CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes中,6?C, 22?C或37?C三種保存溫度下保存的血液,直到第7天cell-free DNA濃度都沒(méi)有顯著改變。
4. 運(yùn)輸穩(wěn)定性(Shipping stability)
使用CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tubes采集保存的血樣能經(jīng)受42?C溫度,不影響血中cell-free DNA濃度。
實(shí)驗(yàn)方法:將ProTeck采血管采集的血樣,通過(guò)FedEx運(yùn)輸往哥倫比亞,亞利桑那等地,經(jīng)受兩天42?C,與室溫保存的樣品比較cell-free DNA濃度沒(méi)有顯著改變,而在K3EDTA管中保存的血樣cell-free DNA濃度顯著升高(droplet digital PCR技術(shù)檢測(cè)β-Actin基因片段)。
5.甲醛檢測(cè)
NMR檢測(cè)顯示CFGenome的Blood Exo DNA ProTeck® tube不含甲醛。